Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AMER3Q8N944 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms