Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST3Q8N1M1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms