Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT28Q7Z3Y7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms