Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BHLHA9Q7RTU4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms