Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms