Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP34Q70CQ2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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