Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms