Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OPN5Q6U736 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms