Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms