Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATAD2Q6PL18 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATAD2Q6PL18 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms