Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRT80Q6KB66 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms