Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms