Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BROXQ5VW32 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms