Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms