Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LACTB2Q53H82 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms