Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPAT3Q53EU6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPAT3Q53EU6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms