Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC39A12Q504Y0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A12Q504Y0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms