Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP13-3Q3SY46 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms