Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL38Q2WGJ6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms