Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CA9Q16790 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CA9Q16790 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CA9Q16790 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CA9Q16790 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CA9Q16790 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CA9Q16790 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CA9Q16790 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CA9Q16790 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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CA9Q16790 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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CA9Q16790 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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