Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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