Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms