Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA3Q16281 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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