Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP4Q15650 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms