Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms