Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PDCD1Q15116 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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