Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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LAPTM4AQ15012 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LAPTM4AQ15012 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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LAPTM4AQ15012 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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LAPTM4AQ15012 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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LAPTM4AQ15012 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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LAPTM4AQ15012 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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LAPTM4AQ15012 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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