Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H2Q13888 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H2Q13888 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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