Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTCH1Q13635 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
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