Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNW1Q13573 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms