Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BFSP2Q13515 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BFSP2Q13515 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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