Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 MED20-203ENST00000409060 815 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LINC00426-204ENST00000420219 1056 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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MKRN4PQ13434 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MKRN4PQ13434 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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