Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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TRIM32Q13049 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM32Q13049 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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