Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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