Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms