Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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