Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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KCNMA1Q12791 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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KCNMA1Q12791 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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KCNMA1Q12791 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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KCNMA1Q12791 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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KCNMA1Q12791 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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KCNMA1Q12791 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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