Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms