Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms