Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms