Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PAX8Q06710 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms