Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSME1Q06323 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSME1Q06323 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms