Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC18A2Q05940 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms