Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms