Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms