Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CENPCQ03188 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms