Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms