Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC104455.1-201ENST00000417340 736 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ZRANB2-207ENST00000611683 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AP003072.3-201ENST00000623456 594 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 OR4C5-201ENST00000319813 981 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC008799.2-201ENST00000484429 647 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 C1orf112-208ENST00000496973 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ENY2-208ENST00000520147 857 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AL137796.1-201ENST00000608190 577 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AC044839.1-208ENST00000634902 917 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB1Q02641 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms