Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms