Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms